มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรีมีนโยบายให้คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีจัดทำหลักสูตรการแพทย์แผนไทยบัณฑิต และดำเนินการเตรียมความพร้อมในการเปิดทำการสอนพร้อมกับเตรียมการจัดตั้งศูนย์ศึกษาสาธิต วิจัย และบริการแพทย์แผนไทย ควบคู่กันไปโดยมีเป้าหมายจะเปิดทำการสอนในปีการศึกษา 2554
            สาขาวิชาการแพทย์แผนไทยได้เร่งดำเนินการจัดทำหลักสูตรการแพทย์แผนไทยบัณฑิตส่งให้กับสำนักสถานพยาบาลและการประกอบโรคศิลปะพิจารณา โดยคณะอนุกรรมการวิชาชีพด้านการสืบทอดความรู้ผ่านสถาบันการศึกษาเป็นผู้รับผิดชอบพิจารณา และสาขาวิชการแพทย์แผนไทยได้แก้ไขตามคำแนะนำของคณะอนุกรรมการฯ อย่างต่อเนื่องและเร่งด่วน
            คณะอนุกรรมการฯ มีมติรับรองเอกสารหลักสูตรการแพทย์แผนไทยบัณฑิต และนัดหมายตรวจเยี่ยมสถานที่เพื่อรับรองสถาบันต่อไป
         ผลการตรวจประเมิน คณะกรรมการวิชาชีพฯ ได้พิจารณาและมีมติรับรองเมื่อวันที่ 15 พฤษภาคม พ.ศ. 2555 ให้คณะวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี มหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรี เป็นสถาบันที่จัดการเรียนการสอนตามหลักสูตรการแพทย์แผนไทยบัณฑิต (หลักสูตรใหม่ พ.ศ. 2555) และได้จัดส่งหนังสือรับรองสถาบันฯ มาให้เป็นที่เรียบร้อยแล้ว
           ในปี พ.ศ. 2558 สาขาวิชาการแพทย์แผนไทย ได้โอนย้ายสาขาวิชาไปสังกัดคณะพยาบาลศาสตร์ ตามคำสั่งมหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรีที่ 18/2558 เรื่องการโอนย้ายสาขาวิชาไปสังกัดคณะพยาบาลศาสตร์ ลงวันที่ 9 มกราคม 2558 เป็นต้นไป เพื่อให้การบริหารจัดการหลักสูตร และการใช้ทรัพยากรร่วมกันของกลุ่มวิทยาศาสตร์สุขภาพ ให้เกิดความเขมแข็งทางวิชาการ มีความคล่องตัวและบรรลุวัตถุประสงค์ ส่งผลต่อการผลิตบัณฑิตให้มีความเข้มแข็งมากยิ่งขึ้น
            ในปี พ.ศ. 2558 สาขาวิชาการแพทย์แผนไทย ได้ปรับปรุงหลักสูตรการแพทย์แผนไทยบัณฑิต (ฉบับปรับปรุง พ.ศ. 2558) เพื่อให้ความทันสมัย สอดคล้องกับสถานการณ์สมัยนั้น และเป็นไปตามประกาศของสภาการแพทย์แผนไทย ซึ่งต่อมาได้รับการรับรองหลักสูตรการแพทย์แผนไทยบัณฑิต (ฉบับปรับปรุง พ.ศ. 2558) เป็นที่เรียบร้อยแล้ว
            ในปี พ.ศ. 2562 สาขาวิชาการแพทย์แผนไทย ได้ปรับปรุงหลักสูตรการแพทย์แผนไทยบัณฑิต (ฉบับปรับปรุง พ.ศ. 2563) ซึ่งเป็นไปตามวงรอบการปรับปรุงหลักสูตร ของสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา และเพื่อให้สอดคล้องกับประกาศกระทรวงศึกษาธิการ เรื่องมาตรฐานคุณวุฒิระดับปริญญาตรี สาขาการแพทย์แผนไทย พ.ศ. 2560 โดยหลักสูตรการแพทย์แผนไทยบัณฑิตได้รับการรับรองจากสภาการแพทย์แผนไทย เมื่อวันที่ 22 มกราคม พ.ศ. 2563 และมหาวิทยาลัยราชภัฏเพชรบุรี ได้รับการรับรองต่ออายุสถาบันเป็นสถาบันที่ผลิตบัณฑิตแพทย์แผนไทย เมื่อวันที่ 27 เมษายน พ.ศ. 2563 เป็นที่เรียบร้อยแล้ว